Ha a foggyökér csúcsa körül gyulladás (granuloma, tályog, ciszta) alakul ki, szükségessé válhat a gyökércsúcs műtéti eltávolítása, a foggyökér rezekció.Ennek alapfeltétele egy új, steril gyökértömés készítése a fogban. Ennek megszilárdulását követően kezdődhet a műtét, amely során a gyökércsúcs helyének megfelelően metszést ejtünk az ínyen és kis lebenyt készítünk, hogy hozzáférjünk a gyökércsúcshoz. A gyökércsúcsot fúróval eltávolítjuk a környező gyulladt szövetekkel együtt, így csak egy tiszta kis csontüreg marad vissza a gyökér körül. Az ínyt néhány varrattal egyesítjük, amelyeket egy hét gyógyulás után eltávolítunk. A csontosodási folyamat általában 4-6 hónapot vesz igénybe, amit röntgenen ellenőrzünk. Nagyobb gyulladások esetén, amikor a csontüreg is nagyobb, sokszor szükséges csontpótló anyag használata is.